Basic HTML Version
Bezmiâlem Aktüel 2020 /
43
kopya sayıları logaritmik olarak tespit edilebilmekte,
böylelikle birkaç kopyadan milyarlarca kopyaya kadar
olan miktarlar belirlenebilmektedir.
Polimeraz zincir tepkimesi, özellikle klinik viroloji
alanındayoğunbiçimdekullanılmaktadır.Buyöntemle,
viremi evresine sahip olan viral infeksiyonlarda
virüsün kanda bulunup bulunmadığı ve kandaki virüs
miktarı tespit edilmektedir. Böylelikle, insan immün
yetmezlik virüsü, hepatit B ve hepatit C virüsünün
plazmadaki miktarları Bezmiâlem Vakıf Üniversitesi
Hastanesi Klinik Mikrobiyoloji Laboratuvarlarında
rutin olarak tespit edilmektedir. Bu önemli
patojenlerin antiviral tedaviye verdikleri yanıtın PCR
ile takibi ve tedavinin bu yanıta göre şekillendirilmesi
ve tabiiki başarılı antiviraller neticesinde, HIV, HBV
veya HCV gibi ölümcül patojenler kronik infeksiyon
haline dönüştürülebilmiştir. Bunlara ek olarak,
Cytomegalovirus, Herpes Simplex Virüsleri ve
tüberküloz ajanı bakteri Mycobacterium tuberculosis'i
balgam örneklerinde testpit eden versiyonlarının
da laboratuvarımızda işlevsel olması konusunda
çalışmalarımız devam etmektedir. Ancak PCR testinin
bu alanlardan tamamen ayrı olarak, televizyon
kanallarında ve güncel sohbet konuları arasında
popüleritesini artıran COVID-19'daki en güvenilen
test olması özelliği olmuştur. Her nekadar COVID-19
hastalarının önemli bir oranı RT-qPCR'da negatif olsa
da, virüse ait genetik materyalin test ortamında somut
biçimde gösterildiği ve rutin kullanıma izin veren
bir yöntem olması hasebiyle RT-qPCR en güvenilir
test ve altın standart olarak kabul edilmektedir.
Bu testte, test edilen virüsün genetik dizlerine
özgü primerler kullanıldığı için, COVID-19 ajanı
Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus-2
(SARS-CoV-2) ile en yakın akrabaları olan diğer
coronavirüsleri, örneğin 2002 yılında pandemiye
neden olan SARS-CoV ve 2012 yılında infeksiyona
neden olan Middle Eastern Respiratory Syndrome
(MERS) ajanını ayırt edebilmektedir. Testte kullanılan
ve primer adı verilen kısa sentetik oligonükleotid
parçalarının bağlanacakları ve amplifiye edecekleri
bölgeler özellikle korunmuş (conserved) olan
bölgelerden seçilmektedir. Böylelikle, pandemi
süresince oluşabilecek ve virüsün hayati özelliklerini
büyük oranda değiştirmeyecek, mutasyonlardan
etkilenmeyen ve virüsün pandemi süresince
tespit edilmesine mani olmayacak gen bölgeleri
hedeflenmektedir. Bu tür genlere en iyi hedefler,
coronavirus özelinde, virüsün genetik replikasyonunu
gerçekleştiren RNA polimeraz geni ve virüsün
içsel -internal- proteinlerinden olan nükleokapsit
genleri olarak kabul edilmektedir. Dolayısıyla gerek
Dünya Sağlık Örgütü gerekse Amerikan Hastalıklar
Kontrol ve Korunma Merkezince pandeminin
başlarında yayınlanan primer dizilerinde bu genlere
özgü primerlerin sekansları uygun ve RT-qPCR'da
kullanılması tavsiye edilen diziler olarak belirlenmiştir.
Türkiye'de Sağlık Bakanlığınca dağıtılan testlerde de
polimeraz genine özgü primerler kullanılmaktadır.
Sonuç olarak, yaklaşık 35 yıllık parlak bir geçmişe
sahip PCR testi, COVID-19’un tüm dünyayı sardığı
günümüzde, en güvenilir teşhis yöntemi olarak
yaygın biçimde kullanılmaktadır. Öyle görünüyor
ki, daha güvenilir ve daha pratik bir test yöntemi
geliştirilip laboratuvarlarda yerlerini alıncaya kadar,
PCR, infeksiyon salgınlar, genetik hastalıklar ya
da kanserlerde en duyarlı ve en özgün diyagnostik
yöntem olarak hakimiyetini devam ettirecektir.