Dr. Ahmet Cingöz, agresif beyin tümörlerinde tedavi direnci ve tümör metabolizması alanlarında uzmanlaşmıştır. Lisans eğitimini İstanbul Üniversitesi Biyoloji Bölümü'nde tamamlamış, ardından Marmara Üniversitesi Tıbbi Biyokimya alanında yüksek lisans derecesini almıştır. 2019 yılında Koç Üniversitesi Hücresel ve Moleküler Tıp programında doktora eğitimini tamamlamıştır. Doktora eğitimi sırasında, Harvard Medical School bünyesindeki Kök Hücre ve Translasyonel İmmünoterapi Merkezi'nde araştırmalar yürütmüş; burada preklinik hayvan modelleri kullanarak beyin kanserine yönelik hedefe yönelik tedavi stratejileri üzerine çalışmıştır. Daha sonra, Koç Üniversitesi Translasyonel Tıp Araştırma Merkezi (KUTTAM) bünyesindeki Beyin Kanseri Araştırma ve Tedavi Laboratuvarı'nda doktora sonrası araştırmalarına devam etmiş; tedaviye dirençli glioblastomanın moleküler mekanizmaları ve hayvan modellerinin geliştirilmesi üzerine odaklanmıştır.
Araştırma Alanı: Moleküler kanser biyolojisi
Uzmanlık Alanları
Kanserde tedavi direnci, tümör metabolizması, tümör heterojenitesi
Devam eden çalışmalar
Cingöz Laboratuvarı, özellikle glioblastoma başta olmak üzere agresif kanserlerde tedavi direncinin moleküler ve metabolik mekanizmalarının anlaşılmasına odaklanmaktadır. Araştırmaları, tümör hücrelerinin terapötik baskıya metabolik plastisite ve tümör heterojenitesi aracılığıyla nasıl adapte olduğunu ve bunun sonucunda nasıl dirençli fenotipler geliştirdiğini ortaya koymayı amaçlamaktadır.
Bu sorulara yanıt verebilmek amacıyla araştırma grubu; transkriptomik, metabolomik ve CRISPR tabanlı fonksiyonel genetik taramaları, hasta kaynaklı primer tümör örnekleri ve klinik açıdan anlamlı direnç modelleriyle birleştiren bütüncül bir çoklu-omik yaklaşımlar kullanmaktadır. Bunun yanında, oksidatif fosforilasyon ve lipid metabolizması gibi yolakların tümör hücrelerinin hayatta kalmasına ve tedaviden kaçışına nasıl katkıda bulunduğunu araştırılmaktadırlar.
İn vitro ve in vivo deneysel modellerin ileri biyoinformatik yöntemlerle entegre edildiği bu çalışmaların temel amacı, hedeflenebilir moleküler ve metabolik hedefleri belirlemek ve tedaviye dirençli beyin tümörleri için daha etkili tedavi stratejileri geliştirmektir.
https://cingozlab.com
Cingöz Laboratuvarı, tedavi direnci ve tümör metabolizması alanlarına önemli katkılar sunmaktadır. Bu çalışmalar, BILSAB'ın küresel sağlık araştırmaları hedeflerini desteklemektedir.
Vizyon
Dr. Ahmet Cingöz, agresif kanserlerde tedavi direnci ve tümör adaptasyonunu şekillendiren biyolojik mekanizmaları ortaya çıkararak translasyonel kanser araştırmalarını ileri bir boyuta taşımayı hedeflemektedir. Uzun vadeli amacı, bütüncül, veri odaklı ve hasta merkezli araştırma yaklaşımlarıyla daha hassas ve etkili tedavi stratejilerinin geliştirilmesine katkı sağlamaktır.
Bilimsel keşiflerin ötesinde, genç bilim insanlarına mentorluk yapmayı amaçlamaktadır. Disiplinlerarası iş birliklerini teşvik ederek merak, yenilikçilik ve bilimsel mükemmeliyet kültürünün gelişimini desteklemektedir. Bu doğrultuda, Türkiye'de küresel ölçekte bağlantılı ve bilimsel açıdan rekabetçi bir araştırma ekosisteminin oluşmasına katkıda bulunmayı hedeflemektedir.
Yaklaşım
Cingöz Laboratuvarı'nın yürütücüsü olarak Dr. Ahmet Cingöz, Türkiye'de güçlü, iş birliğine dayalı ve uluslararası bağlantılara sahip bir bilimsel topluluk oluşturmayı; aynı zamanda gelecek vadeden araştırmacıların ve öğrencilerin gelişimini desteklemeyi hedeflemektedir. Yaklaşımı, temel moleküler biyoloji bilgisini klinik açıdan anlamlı uygulamalarla birleştiren disiplinlerarası ve translasyonel kanser araştırmalarına dayanmaktadır. Üniversite hastanesi ve iş birlikçi araştırma ağlarıyla yakın etkileşim içinde çalışan laboratuvar, ileri düzey deneysel teknolojiler, multi-omiks yaklaşımlar, hesaplamalı analiz yöntemleri ve hastadan türetilmiş modelleri bir araya getirerek tedavi direnci, tümör metabolizması ve kanser biyolojisindeki temel sorulara yanıt aramaktadır.
Bunun yanı sıra, genç araştırmacılara ve öğrencilere güçlü bir bilimsel eğitim, eleştirel düşünme becerisi ve ileri düzeyde deneysel ve hesaplamalı yöntemlerde uygulamalı deneyim kazandırarak yeni nesil bilim insanlarının yetişmesine büyük önem vermektedir. İş birliği, merak ve bilimsel mükemmeliyet üzerine kurulu bir araştırma ortamı içinde, akademi ve biyomedikal inovasyon alanlarında uluslararası düzeyde etkili katkılar sunabilecek nitelikli araştırmacılar yetiştirmeyi amaçlamaktadır.
Ekip
Demet İnci
Furkan Emre Bora
Hatice Arslan
Ezgi Kuzu
Projeler
- Glioblastomada Lipit Metabolizmasının Apoptotik Terapi Direncindeki Rolünün Aydınlatılması (Yürütücü, TÜBİTAK-1001)
- Glioblastoma Hücrelerinde Apoptotik Terapi Direncinde Rol Oynayan Metabolik Faktörlerin Araştırılması (Yürütücü, TÜBİTAK-3501)
- İn vivo CRISPR/Cas9 Tarama Yöntemi İle Glioblastomada Tümör Metabolizmasının Rolünün İncelenmesi (Yürütücü, TÜSEB-A4)
- TRAIL-Dirençli Glioblastoma Hücrelerinde Oksidatif Fosforilasyon Mekanizmalarının Moleküler Düzeyde Araştırılması (Yürütücü, BVU-BAP)
- Tedaviye Dirençli Beyin Kanserlerinde Tümör Metabolizmasının Rolünün Araştırılması (Yürütücü, Koç Üniversitesi RSF)
Lab alumni
Yayınlar (seçilmiş):
- Dogan NO, Suadiye E, Unangst J, Dayan CB, Richter G, Cingöz A, Bagci-Onder T, Sitti M. “Genetically engineered human cell-based microrobots for selective cancer cell death". Science Advances, 2026. 12, eaea9831. DOI:10.1126/sciadv.aea9831.
- Ersoy-Fazlioglu B, Lingadahalli S, Altintas UB, Cingöz A, Tekoglu E, Yu IPL, Dikbas M, Missaghimamaghani O, Yavuz K, Andomat H, Kulac I, Morova T, Xiao K, Gleave M, Fazli L, Cejas P, Cherkasov A, Zwart W, Haffner MC, Long H, Collins C, Bagci-Onder T, Lack NA. “Distinct transcription factor interactions drive HOXB13 activity in different stages of prostate cancer." PNAS, Dec 2025. https://doi.org/10.1073/pnas.2500327122.
- Yedier-Bayram O, Cingöz A, Yilmaz E, Aksu AC, Esin B, Değirmenci N, Cavga AD, Dedeoğlu B, Cevatemre B, Syed H, Philpott M, Cribbs AP, Oppermann U, Lack, NA, Acilan C, Onder TT and Bagci-Onder T. “Chromatin-focused genetic and chemical screens identify BRPF1 as a targetable vulnerability in Taxol-resistant triple-negative breast cancer." Exp Mol Med., 2025.
- Ozyerli-Goknar E, Kala EY, Aksu AC, Bulut I, Cingöz A, Niuzamuddin S, Biniossek M, Seker-Polat F, Morova T, Aztekin C, Kung S, Syed H, Tuncbag N, Gonen M, Philpott M, Cribbs A, Acilan C, Timmers HTM, Lack NA, Onder TT, Bagci-Onder T. “Epigenetic-focused CRISPR/Cas9 screen identifies ASH2L as a regulator of glioblastoma cell survival". Cell Commun Signal., 2023 Nov 16;21(1):328.
- Yedier-Bayram O, Gökbayrak B, Aksu AC, Cavga AD, Kayabolen A, Kala EY, Karabiyik G, Cingöz A., Günsay R, Morova T, Uyulur F, Lack, NA, Onder TT and Bagci-Onder T. ''EPIKOL, a chromatin-focused CRISPR/Cas9 library identifies cancer-specific epigenetic vulnerabilities''. Cell Death and Disease, 13, 710, 2022.
- Cingöz A, Ozyerli-Goknar E, Morova T, Seker-Polat F, Selvan ME, Gümüş ZH, Bhere D, Shah K, Solaroglu I, Bagci-Onder T. “Generation of TRAIL-resistant cell line models reveals adoption of different mechanisms of acquired resistance and re-sensitization". Oncogene, 40, 3201–3216, 2021.
