Günümüzün ileri teknolojik koşullarında, klasik ışık mikroskopla​rın yanı sıra, polarizasyon mikroskobu, faz kontrast mikroskobu, floresan mikroskop, konfokal mikroskop ve elektron mikroskop gibi çeşitli mikroskopları kullanarak hücrenin bileşenlerine, organellerin en ince özelliklerine veya embriyolojik gelişim aşamalarında etkili olan moleküllere dair detaylı bilgi almak mümkündür. Dahası korelatif mikroskobi teknikleri ile floresan mikroskop altında sitoplazmada görülen pozitif bir boyanmanın elektron mikroskop kullanılarak hangi organeden kaynaklandığı bile anlaşılmaktadır.